En este apartado hay estandarización interanacional, dada por el Genomics Standards Consortium. Algunos de los metadatos mínimos involucran variables como:
- Nombre del colector
- Fecha
- Latitud y longitud
- Descripción del bioma
- Descripción del tipo de muestra
- profundidad
- pH
- Temperatura
- Humedad
En este sentido, vamos a utilizar una plantilla compatible con la información mínima para reportar un estudio de amplicones, metagenomas, genomas. Tener esta información ayuda a los análisis subsecuentes, a subir las secuencias a las bases de datos públicas y a incorporar nuestras muestras a meta-análisis de estudios genómicos.
La plantilla la pueden descargar aquí:
Es obligatorio llenar los campos marcados en ROJO.
Esta tabla será la base de las tablas de datos de análisis y vamos a agregar algunos parámetros extras generales como:
-Calidad del DNA por espectrofotometría (nanodrop). -Calidad del DNA por fluorescencia (qubit). -Nombre de los archivos originales del centro de secuenciación.